优质烃源岩的形成关键在于有机质的高产与有效保存。迅速沉积和掩埋是保存有机物质的重要手段，但沉积物中的细菌活动却会对有机物造成破坏。好氧细菌依赖上覆水中溶解的游离氧来分解沉积物/水界面上的植物和动物遗骸
，而厌氧细菌则在更深层利用发酵过程分解有机物并产生生物甲烷
。这些细菌活动通常局限于沉积物的上部60厘米范围内，因此
，快速的沉积掩埋过程可以缩短细菌的活动时间，进而有利于有机质的保存。

缺氧的水体环境也有助于加强有机物的保存。当水的密度分层导致底层缺氧时，会形成不利于氧气循环的底层环境。这种现象常见于湖泊、泻湖和浅海等水域，其中新鲜的河水进入密集的咸水体，淡水层漂浮在盐水层之上，密度差异阻止了上层光合作用产生的氧气向下层渗透。在缺氧环境中，好氧细菌和以沉积物为食的生物无法生存
，从而减缓了有机物的腐烂速度。同时，厌氧细菌的不完全分解作用促进了有机物向石油的转化
。

(提供分层、缺氧湖泊的示意图模型

，展示出季节性分层与永久性分层的差异)揭示了内陆海，例如黑海和死海，以及湖泊，例如美国西部的大盐湖
，所经历的密度分层与氧气消耗情况
。此外，这种密度分层现象同样出现在环流较少、水域宽阔平坦的大陆架上。在海洋环境中，大约200米深的地方存在一个缺氧区域，而较浅和较深的水域则氧气更为丰富（见图3）。海平面的上升可能使得这个缺氧区域上升至足以覆盖大陆架的高度，这类似于Cenomonian时期的情况
，当时全球范围内的最大海侵创造了富含有机物的页岩。

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